Video: BAM dizin dosyası nedir?
2024 Yazar: Lynn Donovan | [email protected]. Son düzenleme: 2023-12-15 23:54
A BAM dosyası (. bam ) bir SAM'ın ikili sürümüdür dosya . bir SAM dosya (. sam) sekmeyle ayrılmış bir metindir dosya dizi hizalama verilerini içerir. indeksleme : IGV, hem SAM hem de BAM dosyaları pozisyona göre sıralanabilir ve indekslenmiş , ve bu dizin dosyaları belirli bir adlandırma kuralına uyun.
Aynı şekilde, insanlar soruyor, BAM dosyasını nasıl açarım?
itibaren Dosya menü seçimi Açık ve seçin BAM dosyaları sol taraftan. Sağdaki Ekle yazan seç düğmesi BAM dosyası . Şuraya gidin: BAM Ölçek Dosyalar indirdiğiniz klasör with_index_with_graph'ı seçin. Tıklamak Açık , haritayı seçin.
İkinci olarak, bir BAM dosyasını Fastq'a nasıl dönüştürebilirim? BAM Dosyasını FASTQ formatına dönüştürme adımları aşağıdadır. Bu, Linux üzerinde çalışacak ve SAMTOOLS ve BEDTOOLS gerektirecektir.
- SAMTOOLS'u indirin.
- Command tar xzvf samtools-version.tar.bz2'yi kullanarak ayıklayın.
- Samtools-version adında bir klasör oluşturacaktır.
- cd samtools-version dizinine gidin.
Aynı şekilde, bir BAM dosyasını bir SAM dosyasına nasıl dönüştürebilirim?
NS SAM'ı dönüştür ile BAM samtools view komutunu kullanıyoruz. Girişimizin içinde olduğunu belirtmeliyiz SAM biçimi (varsayılan olarak beklediği BAM ) -S seçeneğini kullanarak. Ayrıca çıktının olmasını istediğimizi de söylemeliyiz. BAM (varsayılan olarak üretir BAM ) -b seçeneği ile.
Samtools görünümü ne yapar?
Samtools BAM formatında hizalamaları yöneten bir dizi yardımcı programdır. SAM (Sıra Hizalama/Harita) formatından içe ve dışa aktarır, yapmak sıralama, birleştirme ve indeksleme ve herhangi bir bölgedeki okumaları hızlı bir şekilde almayı sağlar. Samtools bir akış üzerinde çalışmak üzere tasarlanmıştır.
Önerilen:
Android'deki kök dizin nedir?
Kökün, Android işletim sistemini oluşturan tüm dosyaların depolandığı bir cihazın dosya sistemindeki en üstteki klasör olduğunu ve köklenmenin bu klasöre erişmenize izin verdiğini düşünürsek, o zaman rootlu olmak, cihazınızın hemen her yönünü değiştirebileceğiniz anlamına gelir' yazılım
Java'da sınır dışı istisna dışı dizin nedir?
Endeks Sınır Dışı İstisnası. Index Out of Bound İstisnası, çalışma zamanı hatalarında oluşan Denetlenmeyen İstisnadır. Bu, bir koddaki bir yönteme geçirilen geçersiz parametre nedeniyle ortaya çıkar. Java Derleyici, bir programın derlenmesi sırasında hatayı kontrol etmez
Bir TIFF dosyası bir vektör dosyası mıdır?
TIF – (veya TIFF), Etiketli Görüntü Dosyası Biçimi anlamına gelir ve büyük bir tarama dosyasıdır. Dosya bir JPEG gibi bilgi veya kalite kaybetmediğinden, öncelikle baskıdaki görüntüler için bir TIF dosyası kullanılır. Metin, grafik ve illüstrasyon içerebilen vektör tabanlı bir dosyadır
Bir metin dosyası adındaki iki ortak metin dosyası sınırlayıcısındaki sınırlayıcıların amacı nedir?
Sınırlandırılmış metin dosyası, her satırın tek bir kitabı, şirketi veya başka bir şeyi temsil ettiği ve her satırın sınırlayıcıyla ayrılmış alanlara sahip olduğu, verileri depolamak için kullanılan bir metin dosyasıdır
SQL'de dizin ve dizin oluşturma nedir?
SQL CREATE INDEX Bildirimi. CREATE INDEX deyimi, tablolarda dizinler oluşturmak için kullanılır. İndeksler, veri tabanından diğerlerine göre daha hızlı veri almak için kullanılır. Not: Bir tablonun dizinlerle güncellenmesi, bir tablonun dizinler olmadan güncellenmesinden daha uzun sürer (çünkü dizinlerin de güncellenmesi gerekir)